More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3320 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
301 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
291 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
305 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
299 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  32.06 
 
 
305 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
311 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  32.53 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  31.63 
 
 
298 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
306 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
336 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
314 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
364 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
305 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
414 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
411 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
420 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
241 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
320 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  26.86 
 
 
234 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
685 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
448 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1016  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.902573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  27.09 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.11 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.3 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1841  hypothetical protein  26.97 
 
 
241 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0302  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  25.17 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  28.03 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  32.7 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.27 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.2 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1612  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.68 
 
 
410 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  27.96 
 
 
749 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3897  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>