More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8172 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  69.78 
 
 
240 aa  328  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  62.27 
 
 
233 aa  284  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20890  glycosyl transferase  55 
 
 
239 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  55 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  52.17 
 
 
237 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  52.05 
 
 
225 aa  224  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3897  glycosyl transferase family 2  58.29 
 
 
215 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  45.41 
 
 
226 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
230 aa  135  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
230 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
230 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
230 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
293 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
336 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
448 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
355 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
450 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
340 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
232 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
362 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
261 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
340 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
340 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  37.88 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
274 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  30.57 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
347 aa  84.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  30.2 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  37.5 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.38 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  29.05 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  25.23 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  29.77 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.08 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  27.03 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.28 
 
 
749 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
568 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.15 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  29.38 
 
 
352 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
568 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.07 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
374 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  31.88 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0328  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.127312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  32.41 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
411 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
585 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
386 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>