More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0335 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  85.5 
 
 
594 aa  1082    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  74.17 
 
 
572 aa  893    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  96.95 
 
 
623 aa  1237    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  73.34 
 
 
585 aa  897    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  85.44 
 
 
610 aa  1097    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  85.44 
 
 
610 aa  1099    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  69.65 
 
 
606 aa  885    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  72 
 
 
567 aa  881    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  85.11 
 
 
606 aa  1097    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  98.71 
 
 
619 aa  1273    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
619 aa  1290    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  71.08 
 
 
552 aa  860    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  97.09 
 
 
619 aa  1235    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  93.32 
 
 
629 aa  1195    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  74.17 
 
 
567 aa  904    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  50.17 
 
 
572 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  47.63 
 
 
568 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  46.83 
 
 
573 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  46.83 
 
 
573 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  46.32 
 
 
567 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  46.21 
 
 
558 aa  525  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  46.26 
 
 
575 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  45 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  46.44 
 
 
575 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  45.87 
 
 
571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  44.98 
 
 
563 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  45.88 
 
 
593 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  45.21 
 
 
568 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  45.04 
 
 
568 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.16 
 
 
536 aa  329  8e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.63 
 
 
535 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  53.75 
 
 
244 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.5 
 
 
244 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  50.62 
 
 
256 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.42 
 
 
343 aa  246  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  52.54 
 
 
244 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  47.5 
 
 
250 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.16 
 
 
242 aa  233  8.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  39.61 
 
 
315 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  40.26 
 
 
315 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  38.54 
 
 
315 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.31 
 
 
324 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.04 
 
 
313 aa  210  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  46.46 
 
 
252 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  42.92 
 
 
259 aa  196  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.42 
 
 
255 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 
260 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  42.54 
 
 
253 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  42.54 
 
 
253 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
260 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  41.49 
 
 
258 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
268 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
268 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  34.84 
 
 
306 aa  177  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  39.84 
 
 
257 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
262 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  40.69 
 
 
252 aa  174  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 
257 aa  170  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.69 
 
 
299 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 
266 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
270 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
260 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
258 aa  161  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  30.72 
 
 
324 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
256 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  30.07 
 
 
326 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  39.75 
 
 
256 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  29.74 
 
 
326 aa  156  8e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  30.92 
 
 
334 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.79 
 
 
326 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.65 
 
 
314 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  31.43 
 
 
310 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  30.82 
 
 
315 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  30 
 
 
301 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  32.14 
 
 
324 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
395 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  33.78 
 
 
400 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  31.82 
 
 
324 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.93 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.28 
 
 
306 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.41 
 
 
304 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  27.85 
 
 
323 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  29.96 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  30.09 
 
 
320 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  30.84 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  30.52 
 
 
327 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  30.52 
 
 
327 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  35.56 
 
 
389 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.78 
 
 
320 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  30.52 
 
 
323 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  31.2 
 
 
397 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  27.8 
 
 
321 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
234 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  27.81 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.6 
 
 
296 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
399 aa  114  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  25.57 
 
 
298 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>