More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5097 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  89.71 
 
 		 244 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  74.49 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  61.83 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  55.97 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  53.31 
 
 		 568 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  57.56 
 
 		 575 aa  274  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  57.56 
 
 		 575 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  57.38 
 
 		 593 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  52.92 
 
 		 563 aa  268  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  57.02 
 
 		 572 aa  268  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  54.17 
 
 		 558 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  54.17 
 
 		 585 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  50.42 
 
 		 563 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  51.85 
 
 		 606 aa  264  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.92 
 
 		 594 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  55.47 
 
 		 573 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  55.47 
 
 		 573 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  51.85 
 
 		 610 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  51.67 
 
 		 606 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  51.44 
 
 		 610 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  54.32 
 
 		 567 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  52.5 
 
 		 571 aa  259  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  55.46 
 
 		 572 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  52.92 
 
 		 623 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  52.5 
 
 		 619 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  53.09 
 
 		 568 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  52.5 
 
 		 619 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.16 
 
 		 552 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  52.08 
 
 		 619 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  51.25 
 
 		 629 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  52.52 
 
 		 567 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  52.26 
 
 		 568 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  53.02 
 
 		 567 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  51.75 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.55 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.17 
 
 		 535 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.05 
 
 		 536 aa  192  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  41.56 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 268 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.49 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  39.3 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  39.3 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 395 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 377 aa  126  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  30.22 
 
 		 400 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 401 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 386 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  27.94 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  31.67 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  30.8 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 399 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.48 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.06 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1461  glycosyl transferase family protein  20.75 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.691252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  27.98 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.55 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.53 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  31.13 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.12 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.12 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1612  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1016  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.902573  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>