More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2679 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 258 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  79.06 
 
 		 257 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  72.47 
 
 		 260 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  72.06 
 
 		 268 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  72.06 
 
 		 260 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  72.06 
 
 		 268 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  70.71 
 
 		 252 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  70.33 
 
 		 262 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  69.08 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  69.44 
 
 		 258 aa  340  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  66.67 
 
 		 259 aa  338  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  73.22 
 
 		 260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  70.51 
 
 		 270 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.55 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  67.66 
 
 		 266 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  64.54 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  64.54 
 
 		 256 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  64.71 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  64.71 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 		 572 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  40.91 
 
 		 568 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  41.49 
 
 		 571 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 		 552 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 		 623 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  43.03 
 
 		 567 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 		 619 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 		 619 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 		 619 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 		 629 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  38.91 
 
 		 563 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.58 
 
 		 594 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 		 610 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 		 610 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 		 606 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 		 585 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  39 
 
 		 558 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 567 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 		 575 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 568 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  41.56 
 
 		 575 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 		 593 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 		 563 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 		 606 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.52 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.41 
 
 		 568 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 572 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 		 573 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 		 573 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  39.18 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 567 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.12 
 
 		 535 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  41 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 		 536 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 377 aa  128  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  33.07 
 
 		 397 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 401 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  30.4 
 
 		 400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  35.86 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.8 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.64 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  31.34 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.57 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.36 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.3 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.38 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5930  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.16 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  33.69 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.68 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.85 
 
 		 809 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  32.92 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  36.69 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2412  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>