279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0116 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
242 aa  503  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  48.28 
 
 
244 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  48.03 
 
 
619 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  46.12 
 
 
244 aa  234  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
606 aa  234  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  48.03 
 
 
623 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.55 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
619 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
619 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
629 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  44.02 
 
 
256 aa  232  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
610 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  46.72 
 
 
610 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.16 
 
 
594 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.84 
 
 
552 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 
563 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  46.19 
 
 
568 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  45.96 
 
 
571 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  46.29 
 
 
606 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 
573 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 
573 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  43.46 
 
 
563 aa  218  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  46.49 
 
 
585 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  43.7 
 
 
575 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  45.41 
 
 
572 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  45.3 
 
 
558 aa  214  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  43.7 
 
 
575 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  43.29 
 
 
572 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  45.41 
 
 
567 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  43.4 
 
 
567 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  42.98 
 
 
593 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.64 
 
 
536 aa  207  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
567 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  40.17 
 
 
250 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.36 
 
 
535 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  41.48 
 
 
568 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 
568 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
252 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  35.95 
 
 
259 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
258 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
257 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 
255 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
252 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
266 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
262 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
260 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
253 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  33.33 
 
 
253 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
268 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
268 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  34.04 
 
 
257 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
256 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  36.21 
 
 
389 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
256 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
234 aa  113  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
395 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
401 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
377 aa  109  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  27.31 
 
 
400 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
386 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
399 aa  99  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.4 
 
 
397 aa  95.9  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  31.67 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
450 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
313 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.7 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1461  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.691252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  25.56 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1612  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1016  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.902573  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
578 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0302  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  27.27 
 
 
377 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
252 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.11 
 
 
247 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0549  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
243 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.925315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
355 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  26.47 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1303  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1320  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.86 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1339  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193508  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>