More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0792 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  74.31 
 
 
258 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  72.95 
 
 
262 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  74.68 
 
 
270 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  67.74 
 
 
255 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  68.62 
 
 
252 aa  342  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  68.98 
 
 
268 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  68.4 
 
 
260 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  69.71 
 
 
259 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  68.98 
 
 
268 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  68 
 
 
260 aa  337  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  69.51 
 
 
257 aa  337  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  71.01 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  63.89 
 
 
258 aa  323  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  65.38 
 
 
257 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  66.13 
 
 
256 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  66.13 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  64.53 
 
 
266 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  44.58 
 
 
568 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
610 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
610 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 
606 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  42.74 
 
 
606 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.21 
 
 
594 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  43.93 
 
 
623 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
619 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 
619 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
629 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
619 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  42.08 
 
 
563 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
585 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.84 
 
 
552 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
567 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  42.08 
 
 
558 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  40.73 
 
 
571 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 
572 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  40.42 
 
 
563 aa  181  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  39.92 
 
 
256 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  40.93 
 
 
572 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.08 
 
 
244 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  41.88 
 
 
567 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  43.7 
 
 
573 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  43.7 
 
 
573 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  44.77 
 
 
567 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
244 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 
568 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  43.51 
 
 
575 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  43.1 
 
 
575 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  41.84 
 
 
593 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 
568 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  40.5 
 
 
250 aa  164  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.88 
 
 
535 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.4 
 
 
536 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 
242 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
252 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.91 
 
 
389 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
377 aa  118  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  32.14 
 
 
400 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
386 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
395 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  31.36 
 
 
397 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
401 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
246 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
399 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
234 aa  99  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.73 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  28.96 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.91 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.96 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
450 aa  72  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.57 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.69 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.14 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  30.2 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.35 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  30.3 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.91 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.56 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  27.62 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  30.32 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.41459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>