More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3997 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  74.3 
 
 		 260 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  73.9 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  76.71 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  73.49 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  73.9 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  76.92 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  77.54 
 
 		 260 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  73.5 
 
 		 253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  73.5 
 
 		 253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  65.5 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  69.44 
 
 		 257 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  70.33 
 
 		 258 aa  350  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  71.49 
 
 		 252 aa  349  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  66.67 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  68.09 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  67.23 
 
 		 257 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  66.94 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  66.53 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 		 606 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  42.4 
 
 		 575 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  41 
 
 		 571 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 		 623 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 593 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 		 610 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 		 610 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  39.92 
 
 		 568 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 629 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 606 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 		 572 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.21 
 
 		 594 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 619 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 		 573 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 		 573 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 		 568 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 		 619 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 619 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  38.66 
 
 		 563 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 		 575 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 585 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 		 568 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 		 563 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.18 
 
 		 567 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  39.75 
 
 		 558 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 567 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  40.82 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  39.26 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.8 
 
 		 552 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.91 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 		 567 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 572 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  39.5 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 		 535 aa  152  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.14 
 
 		 536 aa  142  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 377 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.75 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  28.24 
 
 		 400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.14 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.41 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 399 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.41 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.63 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 287 aa  72  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 220 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.39 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  24.37 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.31 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.61 
 
 		 749 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>