More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0336 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  92.26 
 
 
594 aa  1157    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  73.32 
 
 
585 aa  901    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  84.24 
 
 
623 aa  1088    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  73.14 
 
 
567 aa  890    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  74.07 
 
 
567 aa  909    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  84.47 
 
 
619 aa  1089    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  98.18 
 
 
610 aa  1244    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  97.85 
 
 
610 aa  1239    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  71.5 
 
 
606 aa  892    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  76.05 
 
 
572 aa  914    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  85.6 
 
 
619 aa  1106    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
606 aa  1264    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  82.96 
 
 
629 aa  1093    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  72.04 
 
 
552 aa  864    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  85.11 
 
 
619 aa  1097    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  52.12 
 
 
572 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  49.28 
 
 
568 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  47.86 
 
 
573 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  47.86 
 
 
573 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  47.23 
 
 
571 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  47.32 
 
 
575 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  47.01 
 
 
567 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  47.14 
 
 
575 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  45.76 
 
 
558 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  45.82 
 
 
563 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  46.85 
 
 
568 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
593 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  44.86 
 
 
563 aa  514  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  46.31 
 
 
568 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.81 
 
 
536 aa  335  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.8 
 
 
535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  52.48 
 
 
244 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.85 
 
 
244 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  50.62 
 
 
256 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.25 
 
 
343 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  52.52 
 
 
244 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  48.99 
 
 
250 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  38.75 
 
 
315 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.94 
 
 
324 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  40.66 
 
 
315 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  39.94 
 
 
315 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.16 
 
 
242 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.16 
 
 
313 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  46.7 
 
 
252 aa  209  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
259 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.42 
 
 
255 aa  188  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 
253 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  41.6 
 
 
253 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
260 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
268 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 
260 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
268 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  39.51 
 
 
258 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
262 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  33.44 
 
 
306 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  39.92 
 
 
257 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
252 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.59 
 
 
299 aa  171  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  39.21 
 
 
257 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
270 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 
266 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
258 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  32.03 
 
 
324 aa  165  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  31.05 
 
 
326 aa  163  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
260 aa  161  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  30.72 
 
 
326 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  38.75 
 
 
256 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  38.75 
 
 
256 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.15 
 
 
314 aa  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  31.46 
 
 
310 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
326 aa  153  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  31.23 
 
 
334 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  29.58 
 
 
301 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.4 
 
 
320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
395 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  32.15 
 
 
324 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  32.15 
 
 
324 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  34.08 
 
 
400 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.98 
 
 
306 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.8 
 
 
304 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  31.02 
 
 
327 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  30.67 
 
 
320 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  30.29 
 
 
315 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  31.51 
 
 
327 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  31.51 
 
 
327 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  26.92 
 
 
323 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  36.91 
 
 
389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.46 
 
 
320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  29.24 
 
 
282 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  29.97 
 
 
323 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  31.25 
 
 
397 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
234 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  26.13 
 
 
298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  27.55 
 
 
321 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
399 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.95 
 
 
296 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
246 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>