More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3936 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  71.54 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  70.73 
 
 		 260 aa  349  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  67.61 
 
 		 262 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  69.92 
 
 		 268 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  69.92 
 
 		 268 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  69.32 
 
 		 257 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  68.07 
 
 		 252 aa  339  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  69.32 
 
 		 258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  66.01 
 
 		 258 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  66.12 
 
 		 259 aa  332  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  69.87 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  70.09 
 
 		 270 aa  328  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  67.61 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  67.61 
 
 		 256 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  66.81 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  64.08 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  64.53 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  64.53 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  40.87 
 
 		 568 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  37.3 
 
 		 563 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.62 
 
 		 594 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 610 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 606 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 606 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 610 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  40.42 
 
 		 571 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  41.67 
 
 		 558 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 585 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 		 619 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 		 563 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 623 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 619 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  39.59 
 
 		 619 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 		 629 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 		 573 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 		 573 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 		 552 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.41 
 
 		 567 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.42 
 
 		 244 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  40.73 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  40.77 
 
 		 572 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 		 572 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 568 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 568 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 567 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 575 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.96 
 
 		 535 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40.91 
 
 		 575 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 		 593 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 567 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.58 
 
 		 536 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 386 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 377 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.88 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 389 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  31.02 
 
 		 400 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 234 aa  92.4  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.07 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.57 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  22.52 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  28.23 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.17 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  28.18 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  24.77 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  29.05 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  30.97 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>