More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4382 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  59.35 
 
 		 256 aa  298  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  56.15 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.97 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  53.91 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  54.66 
 
 		 593 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  54.07 
 
 		 575 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  54.07 
 
 		 575 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  53.28 
 
 		 567 aa  257  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  50.83 
 
 		 567 aa  252  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  50.61 
 
 		 573 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  50.61 
 
 		 573 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.5 
 
 		 552 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  48.99 
 
 		 606 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  50 
 
 		 558 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  47.28 
 
 		 606 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  49.19 
 
 		 563 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 610 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.74 
 
 		 594 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  47.77 
 
 		 610 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  49.37 
 
 		 568 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  49.37 
 
 		 568 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  48.15 
 
 		 585 aa  241  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  45.9 
 
 		 568 aa  241  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  50.85 
 
 		 572 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  49.16 
 
 		 567 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  49.58 
 
 		 572 aa  238  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  46.96 
 
 		 619 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  46.56 
 
 		 623 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  47.5 
 
 		 619 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  48 
 
 		 571 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 629 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  46.56 
 
 		 619 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  43.44 
 
 		 563 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  51.08 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.66 
 
 		 535 aa  187  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.26 
 
 		 536 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.93 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  39.83 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  35.92 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  38.56 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  32.56 
 
 		 400 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 377 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.2 
 
 		 397 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  33.9 
 
 		 389 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 386 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 401 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.23 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 399 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  31.6 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.51 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  30.47 
 
 		 377 aa  79  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  21.84 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  22.57 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3017  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0914269  hitchhiker  0.00000277643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  29.02 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 362 aa  67  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.79 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  30.96 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1461  glycosyl transferase family protein  21.4 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.691252  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.47 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>