More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  100 
 
 		 377 aa  733    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  55.2 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  36.95 
 
 		 578 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  47.77 
 
 		 247 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 220 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  32.44 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 		 220 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  28.57 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 		 448 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.57 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 		 246 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.78 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 234 aa  90.1  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 230 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 230 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 230 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.88 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 606 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.05 
 
 		 535 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  30.47 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  31.22 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 536 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  32.17 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 610 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.82 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 285 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.27 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 594 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 606 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 293 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 619 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 		 694 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  28.73 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  36.18 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  26.27 
 
 		 568 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 		 228 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 567 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  28.64 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.5 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>