More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3919 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  62.08 
 
 
244 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  62.08 
 
 
244 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.83 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  59.35 
 
 
250 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  59.83 
 
 
575 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  60.52 
 
 
572 aa  288  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  60.25 
 
 
575 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  57.09 
 
 
563 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  57.85 
 
 
568 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  55.19 
 
 
558 aa  275  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  51.65 
 
 
568 aa  275  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  51.44 
 
 
563 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  54.62 
 
 
571 aa  271  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  56.79 
 
 
593 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  57.02 
 
 
568 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  57.45 
 
 
573 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  57.45 
 
 
573 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  55.98 
 
 
572 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  55.79 
 
 
567 aa  265  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  53.56 
 
 
585 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  50.83 
 
 
606 aa  263  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.13 
 
 
552 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  51.04 
 
 
610 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  50.62 
 
 
606 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  50.21 
 
 
610 aa  258  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.63 
 
 
594 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  49.61 
 
 
619 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  49.22 
 
 
619 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  50.62 
 
 
619 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  49.61 
 
 
623 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  49.21 
 
 
629 aa  249  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  49.17 
 
 
567 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  48.76 
 
 
567 aa  244  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.02 
 
 
242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  48.9 
 
 
252 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.98 
 
 
535 aa  195  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 
259 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.21 
 
 
536 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  39.5 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 
262 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
258 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 
258 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
260 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 
268 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
260 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  40.16 
 
 
257 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
257 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.21 
 
 
255 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
270 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  39.04 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  38.25 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  34.16 
 
 
400 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
386 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
395 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  36.36 
 
 
389 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
377 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.57 
 
 
397 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
246 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
399 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
450 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  41.25 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  30.18 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  28.37 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  35.19 
 
 
245 aa  72  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.69 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  28.11 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.48 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1024  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.708512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0549  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.925315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.78 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  31.02 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>