More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2297 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  47.56 
 
 
578 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  47.32 
 
 
377 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  43.04 
 
 
374 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
355 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.88 
 
 
247 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  28.26 
 
 
400 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
395 aa  99  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
610 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
336 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
610 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
606 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
220 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.67 
 
 
594 aa  89  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
401 aa  88.6  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
304 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
222 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
629 aa  85.9  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
619 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
619 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
619 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
623 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  31.43 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.47 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
227 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  30.89 
 
 
568 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  29.39 
 
 
250 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
606 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1461  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.691252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
567 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  26.58 
 
 
397 aa  75.5  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  28.7 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.5 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1016  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.902573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1612  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.66 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
585 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.94 
 
 
552 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0302  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  30.17 
 
 
558 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  28.51 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  28.44 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
575 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
571 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
536 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1312  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  26.92 
 
 
563 aa  65.1  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  26.13 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
568 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  28.44 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  26.17 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.19 
 
 
809 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>