More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1367 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
270 aa  547  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  88.98 
 
 
258 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  75.1 
 
 
262 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  78.3 
 
 
252 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  73.6 
 
 
259 aa  374  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  74.5 
 
 
268 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  78.84 
 
 
260 aa  367  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  74.6 
 
 
260 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  74.1 
 
 
268 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  74.68 
 
 
253 aa  364  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  72.62 
 
 
260 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  74.68 
 
 
253 aa  364  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  73.09 
 
 
257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  67.2 
 
 
255 aa  344  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  71.71 
 
 
256 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  71.71 
 
 
256 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  69.51 
 
 
258 aa  341  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  70.09 
 
 
266 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  67.09 
 
 
257 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  41.25 
 
 
568 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
610 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  40.83 
 
 
610 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.08 
 
 
594 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
606 aa  178  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 
623 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 
571 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
585 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 
629 aa  175  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
619 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
619 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
619 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
572 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
606 aa  171  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  39.58 
 
 
558 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
563 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 
572 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  36.07 
 
 
563 aa  168  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 
573 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 
573 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40.08 
 
 
575 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.37 
 
 
567 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.24 
 
 
552 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  38.15 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
593 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.33 
 
 
244 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 
567 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
575 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
567 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
568 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
568 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
244 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  37.04 
 
 
250 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.67 
 
 
535 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.17 
 
 
536 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.62 
 
 
242 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
252 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  33.47 
 
 
389 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
377 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
246 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
401 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  30.4 
 
 
397 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
386 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  27.9 
 
 
400 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
344 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
234 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.75 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  29.6 
 
 
273 aa  72  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.86 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.25 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.43 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  25.33 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
355 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  28.09 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.43 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
243 aa  62.4  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0124  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.854442  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0135  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00814446  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0236  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.855087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  34.17 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  29.5 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  33.75 
 
 
749 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>