More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2109 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  100 
 
 
400 aa  820    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  45.26 
 
 
401 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  46.46 
 
 
395 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  47.25 
 
 
397 aa  342  5e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  46.13 
 
 
377 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  44.26 
 
 
386 aa  318  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  31.18 
 
 
389 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.93 
 
 
247 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
234 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
567 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
623 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
629 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
619 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
619 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.53 
 
 
552 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
619 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
567 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
572 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
606 aa  143  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
610 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
606 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
610 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.29 
 
 
594 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
256 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
246 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
572 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  31.39 
 
 
558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
222 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
593 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
568 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.64 
 
 
220 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
220 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  32.94 
 
 
575 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
244 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  32.56 
 
 
250 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
575 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.56 
 
 
273 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
220 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.48 
 
 
270 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
274 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.63 
 
 
535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  29.28 
 
 
568 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  30.94 
 
 
563 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
244 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
571 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
253 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  32.29 
 
 
253 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  31.86 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
573 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
259 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
573 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 
255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
262 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
258 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
252 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
260 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
260 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 
242 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
266 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
448 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
260 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
229 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
268 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
355 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  30.32 
 
 
257 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
227 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
268 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
355 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
315 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2297  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
247 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
261 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
313 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  31.98 
 
 
225 aa  96.3  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
230 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
230 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.65 
 
 
238 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
230 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
257 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
344 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
256 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
235 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 
243 aa  94  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
270 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
242 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  29.13 
 
 
264 aa  93.2  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
319 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.94 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  28.57 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
230 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
230 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
336 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>