More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0436 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  517  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  83.53 
 
 
260 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  82.35 
 
 
260 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  81.96 
 
 
268 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  81.57 
 
 
268 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  81.64 
 
 
256 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  80.86 
 
 
256 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  69.44 
 
 
262 aa  352  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  71.31 
 
 
252 aa  348  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  69.08 
 
 
258 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  72.18 
 
 
258 aa  339  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  67.21 
 
 
259 aa  334  7e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  73.08 
 
 
270 aa  334  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  65.46 
 
 
255 aa  332  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  70.51 
 
 
266 aa  327  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  70.21 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  70.21 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  71.07 
 
 
260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  66.52 
 
 
257 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  41.7 
 
 
568 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  40.65 
 
 
623 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 
619 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 
610 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 
619 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.66 
 
 
594 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 
610 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 
619 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
629 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
606 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
606 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.56 
 
 
244 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
571 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  37.92 
 
 
563 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
585 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  43.82 
 
 
575 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.75 
 
 
552 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
568 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  42.56 
 
 
573 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
572 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  42.56 
 
 
573 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  42.57 
 
 
575 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
567 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 
593 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
563 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
568 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  38.78 
 
 
558 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.8 
 
 
567 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
567 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 
244 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
256 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
572 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  35.92 
 
 
250 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
252 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 
242 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.89 
 
 
535 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.12 
 
 
536 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
401 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
377 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
395 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  30.32 
 
 
400 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  35.65 
 
 
389 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  36.64 
 
 
246 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.39 
 
 
397 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
234 aa  96.3  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
386 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.57 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.93 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  30.04 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  31.72 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  33.95 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
229 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.82 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
327 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
362 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 
364 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.1 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>