More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0320 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  76.09 
 
 		 572 aa  923    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  73.9 
 
 		 594 aa  899    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  74.74 
 
 		 619 aa  913    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  74.56 
 
 		 619 aa  906    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  75.18 
 
 		 585 aa  911    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  74.78 
 
 		 610 aa  912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  74.43 
 
 		 610 aa  908    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  71.4 
 
 		 606 aa  869    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 567 aa  1183    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  74.14 
 
 		 623 aa  903    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  73.16 
 
 		 629 aa  902    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  74.17 
 
 		 619 aa  904    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  74.07 
 
 		 606 aa  909    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  72.36 
 
 		 552 aa  871    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  82.36 
 
 		 567 aa  1012    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  50.99 
 
 		 572 aa  558  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  47.65 
 
 		 568 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  47.45 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  46.28 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  46.44 
 
 		 573 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  46.44 
 
 		 573 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  45.37 
 
 		 567 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  45.97 
 
 		 575 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  44.85 
 
 		 563 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  46.17 
 
 		 575 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 		 593 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  46.49 
 
 		 563 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 		 568 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.91 
 
 		 536 aa  318  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.51 
 
 		 535 aa  316  7e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  50.83 
 
 		 250 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  53.02 
 
 		 244 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.02 
 
 		 244 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  49.17 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.32 
 
 		 343 aa  243  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  52.17 
 
 		 244 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  38.44 
 
 		 315 aa  233  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  38.73 
 
 		 315 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  38.1 
 
 		 315 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.11 
 
 		 324 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.41 
 
 		 242 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  47.14 
 
 		 252 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.98 
 
 		 313 aa  207  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 		 259 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.6 
 
 		 255 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  35.35 
 
 		 306 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 253 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  41.67 
 
 		 253 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.13 
 
 		 326 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 260 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 268 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 		 262 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 268 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.93 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  39.57 
 
 		 257 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 252 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 		 258 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.16 
 
 		 299 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 266 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 270 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  29.93 
 
 		 324 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  39.21 
 
 		 257 aa  150  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  31.65 
 
 		 310 aa  150  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 377 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  34.43 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 258 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  31.85 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.39 
 
 		 304 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 260 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  28.35 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  29.62 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  28.04 
 
 		 326 aa  143  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.98 
 
 		 314 aa  143  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 		 256 aa  140  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 		 401 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.03 
 
 		 306 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  37.24 
 
 		 256 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  30.94 
 
 		 324 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  30.62 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  35.59 
 
 		 389 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  31.05 
 
 		 315 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  32.4 
 
 		 282 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  29.58 
 
 		 323 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  29.87 
 
 		 327 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  29.87 
 
 		 327 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  31.21 
 
 		 327 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  30.29 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  28.8 
 
 		 320 aa  120  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.76 
 
 		 320 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 234 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.8 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.35 
 
 		 296 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  28.34 
 
 		 321 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  24.18 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  29.28 
 
 		 332 aa  103  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>