137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0917 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  57.05 
 
 		 326 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  61.72 
 
 		 310 aa  341  8e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  59.73 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  55.41 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  58.78 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  58.11 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  57.67 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  55.86 
 
 		 301 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  57.24 
 
 		 327 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  57.24 
 
 		 327 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  50.5 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  54.4 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  59.4 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  57.72 
 
 		 323 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  52.27 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  51.8 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  52.07 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.08 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.52 
 
 		 299 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  48.85 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  40.4 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  40.2 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  39.87 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 572 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  30.03 
 
 		 563 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  28.76 
 
 		 568 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 575 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  33.97 
 
 		 567 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 573 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  33.99 
 
 		 575 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 573 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  32.25 
 
 		 558 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 606 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 572 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 619 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 619 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  32.45 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 571 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.79 
 
 		 594 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.49 
 
 		 552 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 563 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 568 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  32.35 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 568 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 619 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  31.68 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 		 629 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 623 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 585 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 593 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 606 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.12 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.16 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 610 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 610 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 567 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.48 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  29.24 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 567 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.28 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  28.16 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.48 
 
 		 536 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.75 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.65 
 
 		 535 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.14 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.53 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.93 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.11 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.21 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.76 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.19 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  26.67 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.51 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.16 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.44 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.31 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.182003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.02 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  22 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.83 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.34 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.65 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0031  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.28 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.88 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.44 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  23.71 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.27 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.38 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.32 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.88 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.52 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.74 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  22.75 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.24 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.51 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.96 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.22 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  26.53 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.21 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>