94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5098 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  93.33 
 
 		 315 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  78.21 
 
 		 315 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  43.14 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 		 575 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  43.89 
 
 		 567 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  42.21 
 
 		 575 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.26 
 
 		 594 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.16 
 
 		 552 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 		 593 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 		 606 aa  235  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 		 572 aa  235  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 		 619 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 		 629 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  39.94 
 
 		 623 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 		 619 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 619 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 		 610 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  42.33 
 
 		 573 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  42.33 
 
 		 573 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 		 610 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 		 606 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 567 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 		 585 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 567 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 		 568 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 		 568 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 		 572 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  34.52 
 
 		 568 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 		 571 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  33.86 
 
 		 563 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 		 563 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.39 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  36.25 
 
 		 558 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.8 
 
 		 535 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.67 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.76 
 
 		 536 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.11 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  34.41 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  32.27 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.57 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  32.05 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.69 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  31.37 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  31.68 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  30.72 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.28 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  28.28 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  31.72 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  31.72 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  30.03 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.49 
 
 		 314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.24 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  31.09 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.55 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  30.16 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  28.1 
 
 		 334 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  29.97 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  30.87 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  30.87 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  30.06 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.71 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  27.27 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.65 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  28.88 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.92 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.66 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.97 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.88 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.77 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  27.94 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.64 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.03 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  27.05 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.33 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  25.46 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.74 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.47 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.13 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  29.32 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1181  hypothetical protein  23.86 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.523374  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.65 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.51 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.69 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.31 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.97 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.35 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.94 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.94 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.94 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.14 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  25.31 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>