92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1181 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1181  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.523374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.37 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1204  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.63 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00305247  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  27.37 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.61 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1182  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.27 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.484152  hitchhiker  0.00223707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.69 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.69 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.39 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  24.75 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.3 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.3 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  20 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.66 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.52 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 		 619 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 575 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 593 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.68 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 623 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.45 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 		 619 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.15 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.44 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 619 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.22 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 572 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.95 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.11 
 
 		 552 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.21 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  22.22 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.69 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2004  lipid A biosynthesis acyltransferase  22 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  25.5 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  23.86 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 		 594 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.69 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 629 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.61 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.78 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  24.42 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.45 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.59 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.51 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 568 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.5 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 568 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.08 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.37 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.44 
 
 		 340 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  17.91 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  28.87 
 
 		 568 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  20.19 
 
 		 567 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0990  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.94 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210235  unclonable  0.000000000756062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.1 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  22.58 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 567 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.08 
 
 		 334 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0263  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  20.68 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.93 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.05 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.52 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  27.35 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.68 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  21.43 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.83 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 606 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.86 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 610 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 610 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.16 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.5 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.74 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.64 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  22.42 
 
 		 585 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  18.21 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.15 
 
 		 453 aa  42.7  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.17 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4852  lipid A biosynthesis (KDO)2-(lauroyl)-lipid IVA acyltransferase  20.34 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 567 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.83 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.83 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.49 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.49 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.49 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.76 
 
 		 293 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>