202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1242 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  87.21 
 
 
310 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  74.84 
 
 
310 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  72.26 
 
 
310 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  68.39 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  66.13 
 
 
310 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  67.42 
 
 
310 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.05 
 
 
308 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.43 
 
 
340 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.67 
 
 
334 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.84 
 
 
338 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.07 
 
 
324 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.76 
 
 
324 aa  244  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.41 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.32 
 
 
308 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.63 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.44 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.33 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.85 
 
 
310 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.8 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.79 
 
 
306 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.79 
 
 
301 aa  197  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.04 
 
 
306 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.8 
 
 
308 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.56 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.39 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.32 
 
 
319 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.6 
 
 
304 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.31 
 
 
299 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.25 
 
 
303 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.61 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.89 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.46 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.88 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.54 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.07 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.62 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.72 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.62 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.4 
 
 
331 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.13 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.81 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.07 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.13 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.49 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.88 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.82 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2578  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.35 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.6 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.63 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.62 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.2 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000374186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  24.83 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.28 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  24.32 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  29.89 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.2 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150874  hitchhiker  0.0000000000131974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.2 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.11 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  26.95 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  26.47 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.49 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.81 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.65 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  29.11 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.77 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.4 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  26.37 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.19 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.46 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.22 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.22 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.22 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.29 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0011  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.73 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  28 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.02 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.22 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.8 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00120  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.73 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.02 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.49 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.61 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1551  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.59 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0016  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.83 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.32 
 
 
290 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4183  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.93 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.796584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.18 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.17 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  25.79 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003629  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.24 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.63 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>