More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3420 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  76.43 
 
 
324 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.51 
 
 
318 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.84 
 
 
309 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.85 
 
 
309 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.62 
 
 
316 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.95 
 
 
303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.83 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.78 
 
 
331 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.04 
 
 
302 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.07 
 
 
307 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.62 
 
 
303 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.43 
 
 
305 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.77 
 
 
299 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02623  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.45 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.07 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.78 
 
 
301 aa  113  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0070  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.52 
 
 
306 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0084  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.52 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.83 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26.86 
 
 
291 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.23 
 
 
304 aa  106  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.86 
 
 
294 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.19 
 
 
325 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.25 
 
 
307 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.66 
 
 
302 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.04 
 
 
325 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  28.82 
 
 
278 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.75 
 
 
325 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.07 
 
 
293 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.53 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.66 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.21 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.78 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.74 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.29 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.29 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.35 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  28.99 
 
 
278 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.83 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.54 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.14 
 
 
295 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  28.16 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  27.9 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.84 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.74 
 
 
298 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0195  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.6 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.497265  hitchhiker  0.000661445 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.84 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3839  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.149247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5603  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.86 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.897415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.15 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.93 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.56 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3881  putative acyltransferase  29.76 
 
 
276 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  28.9 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.89 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2726  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  30.29 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  0.0936253 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.87 
 
 
323 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.12 
 
 
340 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  28.33 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.95 
 
 
307 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0706  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.25 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0689551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.82 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.36 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.69 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0684  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.91 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.11 
 
 
300 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.62 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0645  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.37 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.927209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.305601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2592  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.52 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01058  hypothetical protein  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.315282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0190  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.9 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1176  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1433  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1177  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2546  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  0.356214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.98 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.44 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.12 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.73 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.69 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.91 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.5 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.08 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0127  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.4 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308089 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.83 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.46 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  27.65 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0980  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.23 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.975069  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0135  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  25.89 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.04 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.77 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>