More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0091 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
324 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  76.43 
 
 
307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.23 
 
 
318 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.64 
 
 
309 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.3 
 
 
309 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.47 
 
 
303 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  39.8 
 
 
316 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  39.34 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.57 
 
 
331 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.75 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.14 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.66 
 
 
299 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.9 
 
 
294 aa  122  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.87 
 
 
307 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  31 
 
 
278 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.47 
 
 
325 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  28 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.05 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.05 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  27.18 
 
 
291 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.84 
 
 
325 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.47 
 
 
325 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.89 
 
 
298 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.9 
 
 
295 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.05 
 
 
293 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5603  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.86 
 
 
283 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.897415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.82 
 
 
295 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.87 
 
 
302 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.59 
 
 
289 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  27.37 
 
 
281 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.69 
 
 
305 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0195  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.87 
 
 
287 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.497265  hitchhiker  0.000661445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  24.57 
 
 
307 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  27.37 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4843  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.76 
 
 
284 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.88 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.52 
 
 
304 aa  99.4  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.88 
 
 
282 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.12 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3881  putative acyltransferase  29.33 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.18 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  29.29 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.75 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0070  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.66 
 
 
306 aa  96.3  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0084  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.3 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.21 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.41 
 
 
295 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.69 
 
 
309 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02623  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.11 
 
 
286 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.6 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  28.89 
 
 
306 aa  93.2  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.07 
 
 
295 aa  92.8  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.27 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.96 
 
 
290 aa  92  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.12 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.79 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.66 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0127  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.93 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.52 
 
 
301 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2805  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  31.78 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.727491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3251  putative acyltransferase  29.75 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.85 
 
 
313 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.66 
 
 
294 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.07 
 
 
306 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0281  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.77 
 
 
309 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.19 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  25.64 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0706  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.67 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0689551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  27.78 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.26 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3839  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.2 
 
 
314 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.149247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  27.13 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  25.54 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.84 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.38 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0684  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.22 
 
 
291 aa  85.9  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  28.38 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0980  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.73 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.975069  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.52 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0622  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.48 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0723236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.54 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2522  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.7 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.04 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0308  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.26 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.61 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0702  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.48 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.62 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3813  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.72 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02482  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.26 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.34 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2638  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.96 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3201  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.18 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.33 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.32 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2726  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.08 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  0.0936253 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.13 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.98 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.63 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>