More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0369 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
302 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  53.87 
 
 
301 aa  324  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  54.8 
 
 
301 aa  324  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  52.31 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  50 
 
 
307 aa  295  6e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  48.38 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  45.67 
 
 
307 aa  278  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.55 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.88 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.32 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.8 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  29 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.33 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.32 
 
 
316 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.63 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.42 
 
 
304 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26.78 
 
 
291 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.9 
 
 
314 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  29.66 
 
 
307 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.58 
 
 
312 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.87 
 
 
324 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.42 
 
 
331 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.1 
 
 
294 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.65 
 
 
319 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  26.04 
 
 
278 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.46 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.38 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.03 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.38 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.3 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  26.24 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  28.51 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.62 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.56 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.17 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  26.69 
 
 
278 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.16 
 
 
331 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.94 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.75 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.75 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.64 
 
 
281 aa  89.4  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3019  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.78 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000114003  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.96 
 
 
298 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.32 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.06 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.08 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.67 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.37 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.75 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.73 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  23.9 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.82 
 
 
453 aa  82.4  0.000000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  23.77 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  23.77 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  25.5 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1541  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000678324  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.65 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.98 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  25.67 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.26 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.24 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.1 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  25.29 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.4 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  22.65 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.66 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.39 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.26 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.66 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.59 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.65 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.56 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.99 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.43 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.82 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.14 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.17 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.38 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.48 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.64 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.27 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.92 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.21 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.3 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001825  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.48 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000174296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.02 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.36 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.24 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.39 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.24 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.5 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.51 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.25 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0655  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  24.92 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.603489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.41 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>