More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2601 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
301 aa  617  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  57.97 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  55.14 
 
 
298 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  53.18 
 
 
307 aa  335  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  53.87 
 
 
302 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  52.61 
 
 
301 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  47.55 
 
 
306 aa  289  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.62 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.96 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.45 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.55 
 
 
295 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.45 
 
 
295 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.37 
 
 
303 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.06 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.08 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.84 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  28.62 
 
 
291 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.48 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.12 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.68 
 
 
309 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  28.24 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.92 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.87 
 
 
307 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.12 
 
 
301 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26.28 
 
 
291 aa  105  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.1 
 
 
303 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.93 
 
 
306 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.51 
 
 
293 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.2 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  28.74 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.61 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.6 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.27 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.27 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.17 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.47 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3019  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.27 
 
 
300 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000114003  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.45 
 
 
234 aa  94  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.88 
 
 
308 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.21 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.3 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.77 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.6 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.59 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  24.06 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.3 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.29 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.95 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.09 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.52 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.41 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.28 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.3 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  23.68 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.98 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.3 
 
 
308 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.79 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.55 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.94 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.71 
 
 
289 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.65 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  24.43 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.83 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  29 
 
 
326 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.55 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.67 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.92 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.17 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  24.5 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.69 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.89 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  22.93 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  21.21 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.88 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.13 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  27.64 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.92 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  27 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.46 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.24 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.43 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.71 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.64 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.93 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.42 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.26 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.59 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.42 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.59 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.29 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.92 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0655  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  24.21 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.603489  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2592  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.52 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00440873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.61 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>