196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1502 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  87.1 
 
 
310 aa  554  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  75.16 
 
 
310 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  75.48 
 
 
310 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  70.65 
 
 
310 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  69.03 
 
 
310 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  68.39 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.32 
 
 
308 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.75 
 
 
340 aa  278  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.75 
 
 
334 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.84 
 
 
338 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.25 
 
 
324 aa  254  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.63 
 
 
324 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.63 
 
 
324 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.93 
 
 
311 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.38 
 
 
310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.86 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.12 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.54 
 
 
308 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.46 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.98 
 
 
311 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.79 
 
 
306 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.4 
 
 
301 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.47 
 
 
306 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.66 
 
 
306 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.79 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.47 
 
 
319 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.59 
 
 
304 aa  113  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.18 
 
 
303 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.02 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.68 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.67 
 
 
307 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.72 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.92 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.77 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.11 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.22 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.27 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.94 
 
 
453 aa  79  0.00000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.91 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.91 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  27.31 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.08 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.72 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.1 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.26 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.01 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.1 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.31 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  29.54 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2578  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.5 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074323 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.05 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.81 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.7 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.8 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.51 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  23.41 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  28.19 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.8 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.46 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.6 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.29 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.71 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.42 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.29 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.04 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000374186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.04 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.78 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.4 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.2 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150874  hitchhiker  0.0000000000131974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.4 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.77 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.74 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00120  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.66 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0011  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.05 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.46 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.81 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  24 
 
 
305 aa  62.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.89 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3839  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.92 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.149247  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  23.88 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  24 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.14 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.15 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.18 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.41 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.83 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  26.85 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.13 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.182003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  29.73 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.56 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.08 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.48 
 
 
280 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.69 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0016  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.2 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>