More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0224 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
331 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  90.61 
 
 
331 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  53.18 
 
 
316 aa  328  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  50.17 
 
 
303 aa  316  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.63 
 
 
309 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.3 
 
 
309 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.54 
 
 
318 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  40.78 
 
 
307 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.57 
 
 
324 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.86 
 
 
304 aa  140  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.97 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.14 
 
 
299 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.53 
 
 
289 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  29.57 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.83 
 
 
297 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.44 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.48 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0070  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.38 
 
 
306 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0084  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.38 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.12 
 
 
303 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.75 
 
 
294 aa  116  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.99 
 
 
307 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.51 
 
 
314 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.84 
 
 
290 aa  109  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  28.63 
 
 
307 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  26.13 
 
 
281 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  26.22 
 
 
281 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.39 
 
 
302 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.39 
 
 
302 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
294 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.85 
 
 
295 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.71 
 
 
291 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.28 
 
 
301 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02623  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.42 
 
 
286 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.39 
 
 
295 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.35 
 
 
306 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  25.18 
 
 
278 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  31.16 
 
 
278 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.39 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.305601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2592  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  25.34 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1433  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1177  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2546  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  0.356214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1176  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01058  hypothetical protein  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.315282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2076  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  0.965956 
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.94 
 
 
453 aa  97.4  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.25 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.09 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1251  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1266  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1222  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.307786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2034  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.55 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2218  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.48 
 
 
306 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.77 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.97 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.16 
 
 
302 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0361  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.27 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0430  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.27 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1232  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.27 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.109491 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.99 
 
 
281 aa  93.6  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2805  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  32.33 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.727491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  27.24 
 
 
295 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.1 
 
 
295 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.41 
 
 
295 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.28 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.96 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.78 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000374186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0136  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.83 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0190  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.44 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4425  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  28.33 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00123056  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.99 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.99 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.72 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150874  hitchhiker  0.0000000000131974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.91 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.29 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02612  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.89 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0658  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.3 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0642773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0038  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.67 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.57 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0032  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.67 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.21 
 
 
313 aa  89.7  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.39 
 
 
295 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1568  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.61 
 
 
308 aa  89.4  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.912268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.54 
 
 
310 aa  89.4  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.27 
 
 
340 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.62 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.89 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0645  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.63 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.927209  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  25.19 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0308  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.63 
 
 
322 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3838  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.31 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.56 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1541  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
619 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000678324  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2005  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.48 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>