More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0768 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  58 
 
 
316 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  51.86 
 
 
331 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  50.17 
 
 
331 aa  316  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  49.17 
 
 
309 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.84 
 
 
309 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  49.01 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.47 
 
 
324 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  41.95 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.3 
 
 
301 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.48 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.27 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.02 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.45 
 
 
307 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  29.15 
 
 
281 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 
304 aa  126  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  28.78 
 
 
281 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.12 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.96 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.88 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  28.94 
 
 
278 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  28.67 
 
 
278 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  26.67 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.55 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.63 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.33 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.49 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  30 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.27 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26.84 
 
 
291 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.5 
 
 
307 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
295 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.85 
 
 
301 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  29.35 
 
 
304 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.48 
 
 
302 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.48 
 
 
302 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.01 
 
 
295 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.1 
 
 
301 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.45 
 
 
306 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.61 
 
 
297 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.07 
 
 
297 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.62 
 
 
334 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.1 
 
 
306 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02623  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.37 
 
 
286 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.42 
 
 
305 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.19 
 
 
310 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0084  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.76 
 
 
306 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0070  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.47 
 
 
306 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.59 
 
 
294 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
316 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.76 
 
 
294 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.9 
 
 
298 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.51 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.33 
 
 
324 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.21 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.13 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.47 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.47 
 
 
324 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.77 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.54 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.51 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.51 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.17 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.54 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  23.76 
 
 
296 aa  94  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2726  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.66 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  0.0936253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35100  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.17 
 
 
306 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.38 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.17 
 
 
306 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.42 
 
 
338 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.03 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.38 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.31 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0800  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.33 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.27 
 
 
296 aa  89  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.66 
 
 
301 aa  89  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.54 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.42 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.41 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.33 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.26 
 
 
313 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.45 
 
 
308 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  25.82 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0032  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.93 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0038  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.93 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.12 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  26.99 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.17 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  24.83 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.02 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0195  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.38 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.497265  hitchhiker  0.000661445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.08 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1236  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.99 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2638  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.63 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0658  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.92 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0642773 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.08 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.5 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.78 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0708  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.29 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000260022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.35 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>