More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0809 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.52 
 
 
291 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.13 
 
 
314 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.91 
 
 
289 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  38.85 
 
 
304 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.73 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.71 
 
 
307 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.59 
 
 
303 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  31.61 
 
 
307 aa  102  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.77 
 
 
301 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.68 
 
 
299 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.17 
 
 
325 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.78 
 
 
298 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.66 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.39 
 
 
325 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.31 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.58 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.54 
 
 
316 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  29.91 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.59 
 
 
331 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.89 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.21 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.18 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.07 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.08 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.6 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  31.91 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.62 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  26.6 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.21 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.67 
 
 
295 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.07 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  26.24 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.32 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  24.62 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  24.63 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.33 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.2 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  24.53 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.52 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35100  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.25 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.09 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.55 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.33 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.46 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.37 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  25.56 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.54 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2805  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  30.86 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.727491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0016  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.51 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1696  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.92 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.43 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.16 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.24 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  23.51 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0430  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.87 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.18 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1232  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.87 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.109491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0361  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.87 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.63 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0084  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.81 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.5 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.57 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748215  hitchhiker  0.000000000000001019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1236  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.71 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3871  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.61 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1883  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.57 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0070  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.22 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0308  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.43 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1614  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.61 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.12 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.5 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.68 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0190  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.98 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5602  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.52 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.399291  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.18 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.21 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150874  hitchhiker  0.0000000000131974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  26.26 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.41 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1568  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.5 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.912268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00120  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.6 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0800  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.61 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.31 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0154  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.4 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1606  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.98 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1572  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.05 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.811424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.27 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2917  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  26.41 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2666  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  27.15 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.16 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1433  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.16 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1177  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.16 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1176  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.16 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01058  hypothetical protein  27.16 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.315282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2546  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.16 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  0.356214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>