More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1862 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
312 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.2 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.25 
 
 
302 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.76 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.33 
 
 
325 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.18 
 
 
289 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.07 
 
 
325 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 
301 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.58 
 
 
302 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  24.43 
 
 
291 aa  102  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.7 
 
 
325 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.37 
 
 
295 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.31 
 
 
295 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  29.7 
 
 
306 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.67 
 
 
295 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.34 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.64 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.92 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.39 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.17 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  31.67 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.47 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.57 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.82 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.58 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.74 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.13 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.13 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.69 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  31 
 
 
326 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.84 
 
 
307 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  25.62 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.48 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.77 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.21 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.52 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.37 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.21 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.44 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.62 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.75 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  31.09 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.57 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.69 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.37 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.2 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  22.75 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.11 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.95 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.55 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  25.38 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.53 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.53 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  25.44 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.92 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.98 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.08 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.83 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
340 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.41 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  25.09 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.19 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.12 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.74 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.27 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2121  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.91 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.18 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.64 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.58 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2076  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.91 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  0.965956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.305601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2592  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1176  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1177  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2546  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  0.356214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.21 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1433  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.53 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01058  hypothetical protein  29.67 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.315282  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  25.46 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.46 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.53 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5602  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.12 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.399291  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0622  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.12 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0723236  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0702  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.12 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02623  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.07 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  24.81 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.53 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.13 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4425  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  30.77 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00123056  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5725  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.57 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.3 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>