More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1414 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
314 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  55.48 
 
 
291 aa  325  9e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.4 
 
 
289 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  43.79 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.13 
 
 
294 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.68 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.99 
 
 
298 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.29 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.43 
 
 
309 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.51 
 
 
331 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.49 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.29 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.08 
 
 
309 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.3 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.82 
 
 
316 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  29.68 
 
 
307 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.9 
 
 
302 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.45 
 
 
310 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.48 
 
 
303 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.42 
 
 
302 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.93 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.41 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.48 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  29.54 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.05 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  26.67 
 
 
278 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.24 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.5 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.44 
 
 
295 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.34 
 
 
295 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.68 
 
 
326 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.94 
 
 
307 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  26.42 
 
 
280 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.46 
 
 
295 aa  90.5  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1103  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.39 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842223  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.68 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.96 
 
 
290 aa  89  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.09 
 
 
325 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.28 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.09 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.05 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.62 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.01 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.11 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0190  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.37 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  29.6 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.54 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.54 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.43 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0658  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.3 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0642773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1693  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.11 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0308  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.99 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2993  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.01 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.62 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.89 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0281  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.07 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26.22 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0077  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.17 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  24.25 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0800  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  32.4 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3130  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.01 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.54 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0136  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.93 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.84 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5725  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.75 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4372  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3250  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.37 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0350  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.67 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3201  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.5 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.67 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.82 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  23.4 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1551  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.85 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0199  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.74 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.67 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3746  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.28 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  23.77 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.82 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3070  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.52 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.781333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.18 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3100  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.02 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  23.77 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2468  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.02 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2638  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  28.41 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.02 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.78 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  27.24 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6432  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.46 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0575  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.65 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.64 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440061  normal  0.117765 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1520  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0394  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.68 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0128  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.56 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028974 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0198  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.68 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2723  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.09 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.333812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.06 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>