223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0243 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  68.23 
 
 
300 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  68.03 
 
 
297 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  65.41 
 
 
302 aa  384  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  27.9 
 
 
298 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.95 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  28 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 
552 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.77 
 
 
342 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.82 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.57 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.41 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.16 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.63 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
572 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.38 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  25.18 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  27.91 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
606 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.91 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  29.48 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.46 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  26.49 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  28.52 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
619 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.23 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.5 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
572 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.34 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.29 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.71 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
567 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.24 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
585 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.13 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.78 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.57 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
610 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.57 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.09 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.87 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
606 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.87 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.67 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.87 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  28.34 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.72 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.44 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  24.44 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  26.26 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.43 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.81 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
623 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
619 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
563 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.58 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
619 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.17 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  24.04 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  25.68 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.11 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.95 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.29 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
629 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.07 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.11 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.79 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.32 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.95 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.19 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.72 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.23 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.81 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.31 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.46 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.41 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  26.44 
 
 
563 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.74 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.38 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
568 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
568 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.73 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.72 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
575 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.37 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  25.52 
 
 
558 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
573 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  28.19 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  28.19 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
573 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.65 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.79 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.85 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>