More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1676 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
296 aa  610  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.31 
 
 
306 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.29 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.77 
 
 
297 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.26 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.4 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  29.35 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
302 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.33 
 
 
316 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.44 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.77 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.25 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.77 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.77 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.48 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.27 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1541  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.31 
 
 
619 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000678324  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.05 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  23.05 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.58 
 
 
324 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.63 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  24 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.01 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.04 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.31 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  25.61 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  22.68 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1693  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.28 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.69 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.51 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.51 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.98 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.75 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  29.15 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.02 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.34 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3838  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.78 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.61 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.07 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.62 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.91 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.39 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.39 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.66 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.79 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  20.78 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1696  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.74 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.99 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.36 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4183  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.74 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.796584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  20.78 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  21.05 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1236  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.3 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.34 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3871  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.63 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1127  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.6 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.89 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  22.27 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.17 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.16 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1327  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.7 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582863  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1735  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.7 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.85 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.08 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.58 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.9 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1551  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.56 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.05 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  19.41 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3984  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.35 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.27961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.8 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.22 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  20.07 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1614  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.14 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.62 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.22 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2005  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.51 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.06 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35100  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.31 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2723  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  19.93 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.333812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.7 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.71 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1285  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.850336  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0190  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.3 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.74 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.71 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.86 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748215  hitchhiker  0.000000000000001019 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.94 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4372  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.38 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0658  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  20.42 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0642773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0981  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.14 
 
 
290 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.205063  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4842  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.61 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.28 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5725  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.07 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0662  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.26 
 
 
298 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480781  hitchhiker  0.0042632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03452  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.91 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0990  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.36 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210235  unclonable  0.000000000756062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  25.95 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.19 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>