217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3518 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
310 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  77.03 
 
 
310 aa  488  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  72.26 
 
 
310 aa  474  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  67.42 
 
 
310 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  68.39 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  66.77 
 
 
310 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  66.45 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.48 
 
 
308 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.56 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.93 
 
 
334 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.62 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.97 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.97 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.31 
 
 
324 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.59 
 
 
307 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.07 
 
 
310 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.74 
 
 
308 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.49 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.42 
 
 
308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.91 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.56 
 
 
308 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.53 
 
 
306 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.22 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.53 
 
 
306 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.98 
 
 
319 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.48 
 
 
306 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.75 
 
 
295 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.68 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.82 
 
 
304 aa  123  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.51 
 
 
303 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.4 
 
 
299 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.2 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.42 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.08 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.46 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.55 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.21 
 
 
295 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000374186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.21 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0079  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.21 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150874  hitchhiker  0.0000000000131974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.73 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.66 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.1 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.78 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2578  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.38 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  28.68 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.94 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.94 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  25.09 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  28.68 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.14 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.27 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.9 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.37 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.37 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.22 
 
 
453 aa  73.2  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.05 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.95 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  27.78 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0011  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.66 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00120  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.94 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0016  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.15 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0012  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.32 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360143  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.71 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.78 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.27 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  28.33 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.08 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.91 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26.88 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.76 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.92 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  26 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.52 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  26.2 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.16 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.67 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.56 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.71 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.8 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.71 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.65 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.32 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.83 
 
 
324 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.32 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.75 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.04 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.13 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.27 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  28.49 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.52 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  26.49 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.18 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.77 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.52 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  27.42 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  26.49 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>