More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1315 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
306 aa  628  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  59.41 
 
 
308 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  59.08 
 
 
308 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  60.73 
 
 
308 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  52.94 
 
 
311 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  56.21 
 
 
307 aa  346  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.27 
 
 
310 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  52.29 
 
 
311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.37 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.84 
 
 
340 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.75 
 
 
334 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.43 
 
 
324 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.16 
 
 
338 aa  262  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.45 
 
 
324 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.12 
 
 
324 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.35 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.58 
 
 
310 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.7 
 
 
310 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.73 
 
 
310 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.04 
 
 
310 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.21 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.86 
 
 
310 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.92 
 
 
310 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.58 
 
 
308 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.61 
 
 
306 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.58 
 
 
295 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.72 
 
 
306 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.62 
 
 
319 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.08 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  26.04 
 
 
291 aa  107  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.68 
 
 
295 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.3 
 
 
295 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.98 
 
 
289 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.91 
 
 
295 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.84 
 
 
306 aa  99  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.45 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.52 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.32 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.11 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.6 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.59 
 
 
293 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  27 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.23 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.41 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.47 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.91 
 
 
293 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.43 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.04 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.69 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.55 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.35 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.42 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.02 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0622  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.38 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0723236  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0135  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.95 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0702  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.38 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2316  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.46 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.28 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.57 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.45 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02482  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.08 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  23.27 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.52 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  23.27 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0031  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.03 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.36 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  26.67 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.23 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.39 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.39 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.59 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.49 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.02 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003629  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.75 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.32 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.64 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.182003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0182  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  25.76 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1481  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.2 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.44 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.92 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2578  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.54 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.87 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2638  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  27.63 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.71 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.45 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001825  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.05 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000174296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.1 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5603  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.64 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.897415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0684  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.07 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.7 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0706  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.07 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0689551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.87 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.1 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.76 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.45 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.76 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>