39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1481 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1481  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 298 aa  610  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.2 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.78 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.38 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.4 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.18 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.99 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.75 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.92 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.75 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.74 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.76 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.27 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.14 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.21 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.21 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.79 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.38 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.73 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.73 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.32 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.21 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  23.66 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  21.11 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.74 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.23 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.03 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.66 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.47 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.99 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.17 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.53 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.12 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  26.32 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0617  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.46 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.17 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.72 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.28 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>