144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2073 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
320 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  65.22 
 
 
304 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  58.62 
 
 
304 aa  344  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  55.56 
 
 
404 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  57.28 
 
 
307 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  52.33 
 
 
355 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  52.72 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.32 
 
 
310 aa  262  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.17 
 
 
307 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.17 
 
 
307 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.17 
 
 
307 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.19 
 
 
292 aa  258  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.95 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.92 
 
 
328 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.62 
 
 
303 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.82 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  49.16 
 
 
300 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.94 
 
 
335 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.77 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.67 
 
 
317 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.7 
 
 
316 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.3 
 
 
342 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.21 
 
 
310 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.84 
 
 
337 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  45.23 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.04 
 
 
319 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.48 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.03 
 
 
326 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.32 
 
 
318 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.04 
 
 
328 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.07 
 
 
234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.45 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.12 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.7 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.87 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.22 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.37 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.93 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.2 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.17 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.13 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.89 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.32 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.88 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.38 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.18 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  22.07 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.81 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.89 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  24.32 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  24.32 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.82 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.72 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.74 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.19 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.11 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  27.34 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  25.94 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.53 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.46 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.35 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.63 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.46 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  22.49 
 
 
278 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.16 
 
 
291 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1204  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.18 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00305247  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  21.82 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.92 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.79 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.37 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.38 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.13 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.38 
 
 
293 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3838  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.81 
 
 
290 aa  55.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  22.49 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  18.4 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1182  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.45 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.484152  hitchhiker  0.00223707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.92 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.48 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.23 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.21 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.76 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.7 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.23 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.09 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.14 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.77 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.15 
 
 
310 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.21 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.92 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.08 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  17.47 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  18.42 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.61 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.78 
 
 
310 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.33 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000374186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.79 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.2 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>