127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2093 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  100 
 
 
310 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  60.21 
 
 
307 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  56.76 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  56.76 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  56.76 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  52.3 
 
 
303 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.61 
 
 
314 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  52.03 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.93 
 
 
286 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  55.1 
 
 
316 aa  279  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  53.95 
 
 
335 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.02 
 
 
342 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  54.36 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.68 
 
 
304 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.69 
 
 
292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.82 
 
 
310 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.47 
 
 
310 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.53 
 
 
320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  45.95 
 
 
304 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.44 
 
 
404 aa  235  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.89 
 
 
300 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  46.33 
 
 
355 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.16 
 
 
307 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.46 
 
 
328 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.63 
 
 
311 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.09 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  40.44 
 
 
317 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36 
 
 
318 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.34 
 
 
326 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.17 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.78 
 
 
234 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  28.63 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.15 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.11 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.68 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.98 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.51 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.57 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.76 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.85 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  26.32 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.31 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.11 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.8 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.19 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  28.72 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.87 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  27.59 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.4 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.22 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.75 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.19 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.4 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  23 
 
 
281 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.99 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.05 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  23 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.92 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.16 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.79 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3273  hypothetical protein  28.1 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.32 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.56 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.87 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.25 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.55 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.42 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.81 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.84 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
295 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.46 
 
 
293 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.14 
 
 
295 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3534  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.71 
 
 
308 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.94 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.21 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.41 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.17 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.51 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.82 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.32 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  25.31 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.17 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.22 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.53 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  24.5 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.13 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  24.9 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.69 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.42 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1181  hypothetical protein  23.98 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.523374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.89 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  23.17 
 
 
307 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0127  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.32 
 
 
289 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1541  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.98 
 
 
619 aa  47  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000678324  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0205  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.94 
 
 
308 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176413  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.31 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.74 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>