117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2773 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
310 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.52 
 
 
284 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.44 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.08 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.58 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.74 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.22 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.86 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.36 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.65 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.35 
 
 
281 aa  59.7  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.7 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.77 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  23.3 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.72 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.53 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.74 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.7 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.17 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.99 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.49 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.74 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  22.7 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.53 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.53 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  24.75 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.84 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.64 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.11 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.49 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0195  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.04 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.497265  hitchhiker  0.000661445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  23.35 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.41 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.09 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.92 
 
 
282 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.182003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.7 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
320 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.5 
 
 
340 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  22.75 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  22.7 
 
 
307 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1315  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.93 
 
 
306 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.43 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.89 
 
 
289 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  26.67 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1181  hypothetical protein  22.41 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.523374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.31 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.78 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0031  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.9 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  21.77 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.46 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.8 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0135  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.35 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.51 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.44 
 
 
453 aa  50.1  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.28 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  22.22 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.93 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.49 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.01 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  20.77 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.89 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.91 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.86 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.13 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.89 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  21.35 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.87 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.84 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.14 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.88 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.73 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.06 
 
 
310 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.48 
 
 
295 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  24.22 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.58 
 
 
325 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.54 
 
 
234 aa  46.2  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.36 
 
 
310 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.22 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  23.01 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  21.25 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2638  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  21.32 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.36 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.96 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.46 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.48 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.4 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  22.55 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.23 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.28 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.37 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  24.5 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  22.55 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0684  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.77 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.98 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>