85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2067 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  98.47 
 
 
326 aa  650    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  100 
 
 
326 aa  662    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  70.53 
 
 
324 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.15 
 
 
299 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.75 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.55 
 
 
304 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  38.33 
 
 
323 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  40.27 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.39 
 
 
306 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.71 
 
 
326 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  40.2 
 
 
315 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  38.78 
 
 
301 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  39 
 
 
320 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  37.92 
 
 
324 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  39.87 
 
 
323 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  37.92 
 
 
324 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  36.52 
 
 
282 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  40.2 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  39 
 
 
320 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  37.75 
 
 
327 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  36.36 
 
 
334 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  37.92 
 
 
327 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  37.92 
 
 
327 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
606 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
610 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
610 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
619 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
619 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.39 
 
 
594 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
629 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 
623 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
585 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
619 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
563 aa  152  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  29.17 
 
 
568 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  37.1 
 
 
332 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.49 
 
 
552 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
606 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
567 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
573 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
573 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
567 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
575 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  31.27 
 
 
567 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
568 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  32.45 
 
 
575 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
568 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
572 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
572 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.84 
 
 
343 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
593 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  29.22 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  29.39 
 
 
558 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  30.87 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.21 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  30.27 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.34 
 
 
290 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.15 
 
 
324 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
571 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.33 
 
 
296 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  27.12 
 
 
298 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.25 
 
 
299 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  27.59 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.25 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.83 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.82 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.92 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.92 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.49 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.71 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  24.66 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  24.91 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  24.21 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.63 
 
 
291 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.04 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.94 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.99 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.47 
 
 
295 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.76 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.54 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  22.55 
 
 
310 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  27.43 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.85 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.86 
 
 
301 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>