125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2748 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  100 
 
 		 310 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  60.2 
 
 		 326 aa  361  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  61.31 
 
 		 334 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  59.32 
 
 		 301 aa  351  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  60.94 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  60.61 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  61.28 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  60.61 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  60.61 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  61.72 
 
 		 315 aa  341  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  61.95 
 
 		 323 aa  338  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  55.67 
 
 		 323 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  60.94 
 
 		 320 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  51.89 
 
 		 306 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  57.47 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  60.27 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  52.13 
 
 		 282 aa  318  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  55.25 
 
 		 314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  50.49 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.21 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  48.7 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  40.27 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  40.54 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  39.25 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 572 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  34.65 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  34.82 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  29.51 
 
 		 563 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.9 
 
 		 552 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 		 572 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 606 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 585 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  33.44 
 
 		 567 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 573 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 573 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  34.41 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  27.18 
 
 		 568 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 568 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 568 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 606 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.96 
 
 		 594 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  34.1 
 
 		 575 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.44 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 610 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 629 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 610 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 619 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 575 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 567 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.56 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 619 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 623 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 619 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 567 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 593 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 571 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 563 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.9 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  28.66 
 
 		 558 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.84 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.42 
 
 		 536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.37 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.48 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  27.27 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  24.07 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  23 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.97 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.82 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.96 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  29.48 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.57 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  25.4 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.96 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  26.42 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.32 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.44 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  28.88 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.04 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0649  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.19 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.47 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.05 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.1 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.27 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.64 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  22.3 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.67 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.67 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.83 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.08 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  21.94 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.69 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3251  putative acyltransferase  30.89 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.83 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3881  putative acyltransferase  24.88 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.95 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0082  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.29 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000070481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0195  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.34 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.497265  hitchhiker  0.000661445 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>