134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1995 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 288 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.18 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  40.4 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.34 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  40.42 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.42 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.78 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.1 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.35 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  26 
 
 		 552 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 606 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  26.96 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 619 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 		 623 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  28.48 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.26 
 
 		 594 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 610 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 610 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 619 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 629 aa  99.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 567 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 619 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.28 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  29.74 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 606 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  26.85 
 
 		 558 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  25.08 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.35 
 
 		 535 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  24.83 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 567 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  25.67 
 
 		 563 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.8 
 
 		 536 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 		 585 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.84 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  27.21 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  27.41 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  27.41 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  24.66 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  23.67 
 
 		 568 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  24.83 
 
 		 326 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.5 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  26.18 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 572 aa  85.5  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  27.04 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  24.5 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  27.04 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  27.04 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.79 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  25.68 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  24.92 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.32 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.18 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  26.88 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  24.46 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.69 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  22.52 
 
 		 573 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  22.52 
 
 		 573 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  22.57 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.79 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  27.05 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  22.61 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  28.17 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 571 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  29.79 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 		 575 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  22.11 
 
 		 567 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.15 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.75 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.31 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  23.43 
 
 		 575 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 		 572 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 568 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 568 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.29 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  29.79 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.84 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.14 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.74 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.17 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.34 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.03 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.43 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.37 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.14 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.3 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  26.29 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.74 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  28.96 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  22.74 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.27 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.15 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.49 
 
 		 404 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.14 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.65 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.46 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.44 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0577087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>