90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0549 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 299 aa  620  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  61.72 
 
 		 292 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  54.33 
 
 		 290 aa  332  5e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.34 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  41.22 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.42 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  26.23 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  26 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  27.14 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.28 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.8 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  24.67 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.47 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.38 
 
 		 552 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 610 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 606 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  25.25 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  24.92 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  24.67 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 610 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.09 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 619 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  23.61 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 619 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.53 
 
 		 594 aa  99  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  26.64 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 619 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.25 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  26.64 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 623 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  27.39 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.3 
 
 		 343 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  24.36 
 
 		 575 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.83 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 571 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  24.44 
 
 		 567 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 572 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  25.49 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  24.41 
 
 		 563 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 573 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 575 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 573 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 629 aa  93.6  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  23 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 567 aa  92.8  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  25.74 
 
 		 327 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  25.74 
 
 		 327 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  23.3 
 
 		 567 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  24.11 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  25.25 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 593 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  22.36 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 536 aa  89  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  22.92 
 
 		 568 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  24.25 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  24.51 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  24.5 
 
 		 558 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  21.97 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  24.2 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 		 568 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  21.94 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.13 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  21.83 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  22 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.57 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.78 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.36 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  25.76 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  22.06 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.64 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.66 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.77 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.59 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.89 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  23.38 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.81 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.94 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.37 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1181  hypothetical protein  22.22 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.523374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  23.9 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  18.61 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  22.28 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  23.12 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.38 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.42 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.55 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>