106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0800 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 		 306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  54.58 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  56.29 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  51.76 
 
 		 324 aa  321  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  51.41 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  52.13 
 
 		 310 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  53.19 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  50.35 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  52.82 
 
 		 327 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  52.82 
 
 		 327 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  52.3 
 
 		 327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  51.8 
 
 		 315 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  51.93 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.95 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  48.77 
 
 		 320 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  49.29 
 
 		 304 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.77 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  45.8 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.14 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  40.2 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  36.52 
 
 		 326 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  36.9 
 
 		 326 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  36.17 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  32.16 
 
 		 568 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 		 572 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  29.25 
 
 		 563 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 568 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  32.14 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 568 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 575 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  32.39 
 
 		 575 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  30.8 
 
 		 567 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 573 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 573 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.03 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 593 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 563 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 606 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.77 
 
 		 552 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  32.65 
 
 		 558 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 572 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 594 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 585 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 571 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 619 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 623 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 610 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 619 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 619 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 610 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 629 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 		 567 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 567 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 606 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  28.28 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.25 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.53 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 		 536 aa  112  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.39 
 
 		 535 aa  105  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.47 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.84 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.37 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.8 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  24.64 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  23.47 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.11 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.56 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.61 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  24.63 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.72 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  24.44 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.32 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  24.15 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.28 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.3 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.26 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.75 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.11 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.75 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1551  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.81 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.21 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.65 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.62 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.69 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0011  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.96 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  22.28 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00120  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.42 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2522  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.86 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.22 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.46 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.9 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.3 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.35 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.14 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2773  putative lipid A biosynthesis acyltransferase  21.69 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.57 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  23.85 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  22.89 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>