88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0434 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  78.21 
 
 		 315 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  77.88 
 
 		 315 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  43 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  42.39 
 
 		 575 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  42.58 
 
 		 575 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 		 593 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  43.37 
 
 		 573 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  43.37 
 
 		 573 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.55 
 
 		 594 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 606 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 585 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 		 606 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.07 
 
 		 552 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  43.42 
 
 		 567 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 		 610 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 		 610 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 		 572 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 619 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 629 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 		 623 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 619 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 		 567 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 619 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 572 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 567 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  40.72 
 
 		 568 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.72 
 
 		 568 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  35.05 
 
 		 568 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 563 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 		 571 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  39.61 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  33.12 
 
 		 563 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.08 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  36.77 
 
 		 558 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.3 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 		 535 aa  193  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 		 536 aa  169  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.07 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  32.26 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  34.65 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.29 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.77 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  32.14 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  30.62 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  32.45 
 
 		 315 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  29.97 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.7 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.57 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  31.8 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  31.37 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  30.74 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.55 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  30.74 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  30.45 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  29.45 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.31 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  28.71 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  29.22 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  29.22 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  30.99 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.09 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  29.81 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  28.1 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.51 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  23.99 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.83 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.2 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.76 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.76 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  27 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  24.84 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  25.12 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.83 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  25.35 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.51 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  30.73 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.73 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.2 
 
 		 301 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.48 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  23.28 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  26.09 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.55 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  20.71 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2004  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.9 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.6 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>