119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1320 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  61.94 
 
 		 332 aa  354  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  57.47 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  50.48 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  55.48 
 
 		 301 aa  309  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  52.92 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  54.49 
 
 		 314 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  51.47 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  53.36 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  53.36 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  53.36 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  53.36 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  53.02 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  51.25 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  52.33 
 
 		 323 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  50.17 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  44.77 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  49.83 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.55 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  45.8 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.19 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  42.9 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  40.2 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  39.87 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 573 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 573 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  35 
 
 		 575 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 593 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  28.43 
 
 		 563 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  32.69 
 
 		 567 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 606 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 572 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  30.99 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 568 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 585 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.8 
 
 		 552 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 629 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  25.31 
 
 		 568 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.44 
 
 		 594 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 606 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 619 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 619 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 623 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 619 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 610 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 610 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.56 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 572 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 567 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  30.19 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 567 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  30.1 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.78 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.85 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.68 
 
 		 535 aa  105  9e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  27.66 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  26.35 
 
 		 558 aa  99  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 563 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.27 
 
 		 536 aa  98.2  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.75 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.41 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  24.43 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  29.49 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 571 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.51 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.68 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.34 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.26 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.22 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.41 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.53 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1736  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.33 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161079  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.66 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.32 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.6 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.76 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.98 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.34 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.69 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.23 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.11 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.14 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.99 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.08 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.47 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.740125  normal  0.695374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3779  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.47 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.48 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.94 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3669  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.41 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  27.73 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.55 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.17 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.24 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0426271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.45 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  30 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>