More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3893 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  73.5 
 
 		 594 aa  900    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  74.83 
 
 		 567 aa  914    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 585 aa  1221    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  72.82 
 
 		 619 aa  893    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  74.48 
 
 		 567 aa  909    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  73.32 
 
 		 610 aa  900    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  72.97 
 
 		 610 aa  895    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  70.19 
 
 		 606 aa  877    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  76.09 
 
 		 572 aa  912    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  73.17 
 
 		 619 aa  897    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  73.32 
 
 		 606 aa  902    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  71.86 
 
 		 629 aa  902    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  72.01 
 
 		 552 aa  852    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  73.34 
 
 		 619 aa  898    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  72.84 
 
 		 623 aa  893    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  50.27 
 
 		 572 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  46.51 
 
 		 568 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  45.39 
 
 		 573 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  45.39 
 
 		 573 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  47.61 
 
 		 563 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  45.95 
 
 		 558 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  45.45 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  45.96 
 
 		 593 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  44.92 
 
 		 563 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  45.62 
 
 		 575 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  45.18 
 
 		 575 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 		 571 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 		 568 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.85 
 
 		 535 aa  334  3e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.97 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.17 
 
 		 244 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  53.56 
 
 		 256 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  52.92 
 
 		 244 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  54.62 
 
 		 244 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.05 
 
 		 343 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  48.15 
 
 		 250 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  39.05 
 
 		 315 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  38.41 
 
 		 315 aa  227  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 		 324 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.69 
 
 		 313 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.49 
 
 		 242 aa  217  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 		 252 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  43.98 
 
 		 259 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.45 
 
 		 255 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  41.23 
 
 		 253 aa  181  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  41.23 
 
 		 253 aa  181  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 260 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 260 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 		 258 aa  174  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 262 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 268 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 268 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 252 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  33.33 
 
 		 306 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  40 
 
 		 257 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 258 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  31.05 
 
 		 324 aa  167  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 		 270 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 266 aa  164  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 		 260 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 395 aa  160  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 257 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  33.44 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  29.58 
 
 		 326 aa  156  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  29.58 
 
 		 326 aa  156  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  36.32 
 
 		 400 aa  154  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.97 
 
 		 299 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.4 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.83 
 
 		 320 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  32.03 
 
 		 301 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 		 256 aa  150  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 		 256 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  29.87 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.26 
 
 		 306 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.39 
 
 		 304 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  30.77 
 
 		 334 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  30.42 
 
 		 324 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  30.1 
 
 		 324 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  30.45 
 
 		 315 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  31.65 
 
 		 282 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  31.98 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  29.45 
 
 		 327 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  29.45 
 
 		 327 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  29.45 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  29.35 
 
 		 320 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  31.12 
 
 		 323 aa  126  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  33.61 
 
 		 389 aa  126  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.35 
 
 		 320 aa  123  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  28.35 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  29.36 
 
 		 332 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  28.2 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 234 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.65 
 
 		 296 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  24.58 
 
 		 298 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>