172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2101 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
304 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  58.62 
 
 
320 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  55.41 
 
 
404 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  55.25 
 
 
304 aa  328  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  58.05 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.55 
 
 
286 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.83 
 
 
355 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50 
 
 
292 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.82 
 
 
300 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.11 
 
 
310 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.1 
 
 
310 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.68 
 
 
307 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.68 
 
 
307 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.68 
 
 
307 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.42 
 
 
314 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.86 
 
 
328 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.36 
 
 
317 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.31 
 
 
335 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.34 
 
 
310 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.95 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.6 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.37 
 
 
342 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.34 
 
 
316 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.46 
 
 
303 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  43.85 
 
 
337 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.48 
 
 
319 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.53 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  39.8 
 
 
317 aa  198  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.58 
 
 
326 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.28 
 
 
328 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.25 
 
 
234 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.2 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.86 
 
 
301 aa  99  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.43 
 
 
288 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  28 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.8 
 
 
302 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  27.23 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.17 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.33 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.33 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.88 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.32 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.72 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  28.14 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.66 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.82 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.24 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.37 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.29 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.28 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.47 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.23 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  25.48 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.64 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.21 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.91 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.57 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.8 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.03 
 
 
343 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  21.57 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.46 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  29 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  21.57 
 
 
281 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.7 
 
 
284 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.86 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.39 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.84 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.9 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.32 
 
 
309 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.11 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.63 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  17.81 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  26.37 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.64 
 
 
453 aa  57.4  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3534  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.89 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.84 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.1 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.92 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.69 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.38 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.92 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.33 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.27 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.38 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.93 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.09 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.49 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.16 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.7 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.27 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.94 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.98 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2106  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.84 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.609835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.04 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.28 
 
 
331 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.2 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.18 
 
 
302 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.64 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.27 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>