107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1922 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  58.98 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  58.98 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  58.98 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  59.31 
 
 
314 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  60.75 
 
 
316 aa  326  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  54.76 
 
 
317 aa  315  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  58.94 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  52.3 
 
 
310 aa  285  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.15 
 
 
307 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.62 
 
 
320 aa  245  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.82 
 
 
286 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.18 
 
 
404 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.93 
 
 
342 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.46 
 
 
304 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  45.26 
 
 
304 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.12 
 
 
292 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  43.75 
 
 
310 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.88 
 
 
335 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.14 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  45.57 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.76 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.09 
 
 
328 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  42.57 
 
 
300 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.39 
 
 
311 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.89 
 
 
337 aa  153  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  36.86 
 
 
317 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.64 
 
 
318 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  34.14 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.87 
 
 
326 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  34.1 
 
 
234 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  26.72 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.32 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.24 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.42 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.74 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.2 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.33 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.11 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.87 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.39 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.09 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.89 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1181  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.523374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.81 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.56 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.4 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.68 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.27 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.27 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.97 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.14 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.25 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3534  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.62 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.26 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.74 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.04 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  24.36 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.66 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.78 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20 
 
 
290 aa  52  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.93 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.89 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.4 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  22.89 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.77 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.84 
 
 
312 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.71 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  29.44 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.69 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.25 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.67 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.17 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.03 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.46 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.64 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0205  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.53 
 
 
308 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.25 
 
 
284 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  24.55 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.81 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.92 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.81 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.29 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.2 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1204  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.29 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00305247  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.79 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.06 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1182  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.54 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.484152  hitchhiker  0.00223707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.24 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0793  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.867069  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.2 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.34 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.74 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  22.91 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.46 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0990  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.76 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210235  unclonable  0.000000000756062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.23 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.55 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.11 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>